پیشگویی پروتئین های ضدیخ با استفاده از روشهای محاسباتی مبتنی بر اطلاعات موجود در توالی

thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه اراک - دانشکده فنی
author مرتضی اسلامی
adviser رضا رافع سیدجواد ظهیری
publication year 1393

abstract

برخی از موجودات سردزی پروتئینی به نام پروتئین های ضدیخ را تولید می کنند که مایع های سلول را دربرابر یخ زدگی محافظت می کنند. این دسته از پروتئین ها در افزایش تحمل دانه های گیاهان در برابریخ زدگی، نگهداری بافت ها در شرایط سرد و تولید گیاهان سردزی کاربرد دارند. شناسایی پروتئین های ضدیخ به خاطر شباهت بسیار کم توالی ها مشکل می باشد. برخی از محققین این موضوع را جهت مطالعه انتخاب کردند اما هنوز درصد دقت پیشگویی به مرز قابل قبولی نرسیده است. ما روشی برای تشخیص پروتئین های ضدیخ ارائه دادیم که از ماشین بردار پشتیبان به عنوان طبقه بندی کننده و اجتماع چهار دسته از ویژگی های آب دوستی، خواص فیزیکی وشیمیایی، درصد حضور اسید های آمینه و اطلاعات تکاملی به عنوان بردار ویژگی استفاده می کند. نتایج تجربی نشان می دهد که روش پیشنهادی کارایی بهتری نسبت به دیگر کارهای انجام شده مشابه در این زمینه دارد.

similar resources

پیشگویی برهم کنش پروتئین و rna با استفاده از روش های یادگیری ماشین بر اساس اطلاعات موجود در توالی پروتئین و rna

بسیاری از عملکردهای rna به تعاملات بین rna و پروتئین ها وابسته است چنانکه درک مکانیزم مولکولی تعاملات rna و پروتئین یکی از مباحث اصلی در علم بیوانفورماتیک به شمار می رود. تعاملات پروتئین و rna نقش مهمی در گستره ی وسیعی از فرآیندهای مختلف سلولی از جمله پیوند و ساخت پروتئین، بیان ژن، پردازش rna، مکانیزم دفاع سلولی و تنظیم رونویسی در بیان ژن جهت مقابله با عوامل بیماری زا دارند. روش های آزمایشگاهی ...

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

full text

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

full text

تخمین SNR ورودی با استفاده از ماسک باینری در سیستم‌های مبتنی بر آنالیز ترکیب شنیداری محاسباتی

در این مقاله، روش جدیدی برای تخمین نسبت سیگنال به نویز (SNR) سیگنال ترکیب ارائه شده است که بر پایه روش آنالیز ترکیب شنیداری محاسباتی (CASA) است. در روش ارائه‌شده، ماسک باینری ایده‌آل (IBM) که به طور معمول هدف محاسباتی سیستم‌های مبتنی بر CASA است، برای تخمین SNR سیگنال گفتار نویزی به کار گرفته می‌شود. روش پیشنهادی با استفاده از IBM و چندین ماسک شبه IBM ارزیابی شده است. این روش، ساده و از نظر محا...

full text

پیشگویی خواص ماکرو ملکولها با استفاده از روشهای مبتنی بر منطق فازی

امروزه روشهای حسابگری در کاربردهای زیستی بسیار بکار گرفته می شوند و کاربرد فراوانی در زمینه های بازشناسی و پیشگویی ساختار، خواص و کارکرد ماکروملکولها پیدا کرده اند. در بسیاری از این کاربردها، عمل پیشگویی درواقع نوعی مساله بازشناسی الگو می باشد. در بسیاری از مسائل بازشناسی الگو ‏‎(pattern recognition)‎‏با طبقه بندی مشاهداتی مواجهیم که به صورت بردار یا رشته ‏‎(sequence)‎‏هایی از متغیرهای تصادفی ن...

15 صفحه اول

شبیه سازی رواناب های سطحی با استفاده از مدل مبتنی بر سامانه اطلاعات جغرافیایی لیسم (LISEM)

شبیه‌سازی پدیده رواناب ناشی از هر بارندگی در برآورد شدت سیل بسیار ارزشمند است. برای حفاظت حوزه‌های آبخیز، استفاده از مدلی که توانایی برآورد رواناب را در زمان‌ها و مکان‌های معین داشته باشد، ضروری است. این پژوهش به منظور شبیه‌سازی رواناب در زیر حوزه زراعی منتهی به شهرک بهزیستی گرگان و همچنین ارزیابی تأثیر سناریوهای مدیریتی پوشش گیاهی در 3 رویداد بارش در سال‌های گذشته با استفاده از مدل فیزیکی لیسم...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}

document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه اراک - دانشکده فنی

Keywords

پروتئین های ضدیخ پیشگویی آب دوستی خواص فیزیکی و شیمیایی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com